Zespół CAKE wykorzystuje autorskie narzędzia modelowe opracowane przez swoich ekspertów, które umożliwiają kompleksową analizę skutków gospodarczych, energetycznych i środowiskowych polityki klimatyczno-energetycznej.
Model d-PLACE (Dynamic Policy-Looking Applied Climate and Energy Model) – globalny model równowagi ogólnej (CGE), służący do kompleksowej oceny gospodarczych, społecznych i środowiskowych skutków polityki klimatyczno-energetycznej oraz zmian zachodzących w światowej gospodarce.
Model MEESA (Model for European Energy System Analysis) – model sektora energetycznego umożliwiający szczegółową symulację różnych scenariuszy transformacji systemu energetycznego w Unii Europejskiej, w tym zmian w strukturze wytwarzania energii, rozwoju technologii oraz zapotrzebowania na paliwa i energię.
Model TR3E (Transport European Economic and Environmental Model) – model sektora transportu pozwalający analizować różne warianty ograniczania emisji CO₂ i innych zanieczyszczeń, w tym wdrażanie nowych technologii, rozwój paliw alternatywnych oraz ocenę skutków ekonomicznych i środowiskowych działań dekarbonizacyjnych.
Model EPICA (Evaluation of Policy Impacts – Climate and Agriculture) – model sektora rolnictwa umożliwiający ocenę wpływu instrumentów polityki klimatycznej na poziom emisji gazów cieplarnianych, wielkość i strukturę produkcji rolnej, organizację gospodarstw oraz dochody sektora rolnego w państwach Unii Europejskiej.